Самое простое решение:
откройте эти MKV в програмее tsMuxeR (2.6.12 например) и в окне "output" выбрать стандарт для Blue-Ray дисков - "Blue-ray folder".
Потом в "ImgBurn" прожгите выходную папку - "записать файлы и папки".
Гарантия чтения 100%.