если сохранить проект под новым именем - с ним можно будет делать что угодно. а времена, когда проекты не считались из-за блокировки файлов прошли после того как адобы "убили" Nucleo для АЕ. была классная считалка и оптимизатор памяти. можно вообще сделать проект, просчитать его и закрыть и забыть. но всё будт посчитано, хоть и потеряется сам проект.