Помогите советом, не понимаю...

[Paul Yux]

или так и должно быть?

Да. Так Должно быть.

Тогда переходы, цветокоррекция тоже просчитываться не будут?

Да. Не будут.

по результатам вывода картинка сильно отличается в Авиде и Р17?

Принято считать, что в P17 картинка лучше.

Для yadrov:
Немного поэкспериментировал над файлом 1 (12-23-2012_132948.m2ts) из сообщения #17.
Положил его на таймлайн. Разбил (N) на две части, добавил 2 фейдера (default), на первую часть добавил эффект - Цвет - Двухцветный (по умолчанию).
Экспортировал в режиме "умный". В итоге, файл получился не битый, пользоваться можно. Но(!) В режиме "умный" скорость вывода была очень медленной, что напрочь меняет сам принцип режима "умный" - с такой медленной скоростью вывода зачем он тогда нужен!
И ещё. Тем, кто работает, а не экспериментирует, как я ("по долгу службы"), эти все заморочки "неприличное слово" сдались! PS17 то работает, то не работает, как карты лягут. Это не дело...

[Aland]

В режиме "умный" скорость вывода была очень медленной, что напрочь меняет сам принцип режима "умный" - с такой медленной скоростью вывода зачем он тогда нужен!

Эффект цвет вынуждает монтажку конвертить, поэтому и медленно, то есть в вашем случае умного режима по сути не было, я пробовал этот режим только с переходами, вывод очень шустрый, быстрее, чем обычное кодирование в mp4.