Ваш случай я и имел ввиду. Подразумевается, что файлы снятые камерой в одном режиме, имеют одинаковые характеристики.
Ещё раз, привожу другой пример.
На таймлайн 2 файла (1, 2) с одинаковыми характеристиками и фейдер (F).
Характеристики файлов:

 File-01.mp4
Общее
Полное имя : D:\VIDEO\Test\File-01.mp4
Формат : MPEG-4
Профиль формата : Base Media / Version 2
Идентификатор кодека : mp42
Размер файла : 94,6 Мбайт
Продолжительность : 4 м. 40 с.
Режим общего битрейта : Переменный
Общий поток : 2825 Кбит/сек

Видео
Идентификатор : 1
Формат : AVC
Формат/Информация : Advanced Video Codec
Профиль формата : High@L3.1
Параметр CABAC формата : Да
Параметр ReFrames формата : 1 кадр
Идентификатор кодека : avc1
Идентификатор кодека/Информация : Advanced Video Coding
Продолжительность : 4 м. 40 с.
Битрейт : 2630 Кбит/сек
Максимальный битрейт : 7812 Кбит/сек
Ширина : 1280 пикселей
Высота : 720 пикселей
Соотношение сторон : 16:9
Режим частоты кадров : Постоянный
Частота кадров : 25,000 кадров/сек
Цветовое пространство : YUV
Субдискретизация насыщенности : 4:2:0
Битовая глубина : 8 бит
Тип развёртки : Прогрессивная
Бит/(Пиксели*Кадры) : 0.114
Размер потока : 88,1 Мбайт (93%)

Аудио
Идентификатор : 2
Формат : AAC
Формат/Информация : Advanced Audio Codec
Профиль формата : LC
Идентификатор кодека : 40
Продолжительность : 4 м. 40 с.
Вид битрейта : Переменный
Битрейт : 192 Кбит/сек
Максимальный битрейт : 202 Кбит/сек
Каналы : 2 канала
Расположение каналов : Front: L R
Частота : 44,1 КГц
Метод сжатия : С потерями
Размер потока : 6,43 Мбайт (7%)

 File-02.mp4
Общее
Полное имя : D:\VIDEO\Test\File-02.mp4
Формат : MPEG-4
Профиль формата : Base Media / Version 2
Идентификатор кодека : mp42
Размер файла : 47,0 Мбайт
Продолжительность : 2 м. 52 с.
Режим общего битрейта : Переменный
Общий поток : 2290 Кбит/сек

Видео
Идентификатор : 1
Формат : AVC
Формат/Информация : Advanced Video Codec
Профиль формата : High@L3.1
Параметр CABAC формата : Да
Параметр ReFrames формата : 1 кадр
Идентификатор кодека : avc1
Идентификатор кодека/Информация : Advanced Video Coding
Продолжительность : 2 м. 52 с.
Битрейт : 2095 Кбит/сек
Максимальный битрейт : 4051 Кбит/сек
Ширина : 1280 пикселей
Высота : 720 пикселей
Соотношение сторон : 16:9
Режим частоты кадров : Постоянный
Частота кадров : 25,000 кадров/сек
Цветовое пространство : YUV
Субдискретизация насыщенности : 4:2:0
Битовая глубина : 8 бит
Тип развёртки : Прогрессивная
Бит/(Пиксели*Кадры) : 0.091
Размер потока : 43,0 Мбайт (92%)

Аудио
Идентификатор : 2
Формат : AAC
Формат/Информация : Advanced Audio Codec
Профиль формата : LC
Идентификатор кодека : 40
Продолжительность : 2 м. 52 с.
Вид битрейта : Переменный
Битрейт : 192 Кбит/сек
Максимальный битрейт : 203 Кбит/сек
Каналы : 2 канала
Расположение каналов : Front: L R
Частота : 44,1 КГц
Метод сжатия : С потерями
Размер потока : 3,94 Мбайт (8%)


Режим Smart (Умный) активизируется:

[Только зарегистрированные и активированные пользователи могут просматривать ссылки. ]

P.S. Чтобы прояснить проблему, предлагаю Вам предоставить два разных семпла (2/3-х минутных).