"Посоветуйте что можно сделать, чтоб не переделывать проект. "
А зачем вы конвертировали MTS в формат WMV?Разве 15-я Студия с ним не справляется? Исходники mts сохранены? Порекомендовал бы для начала попробовать в процессе загрузки проекта, где вместо wmv "серые окошки" подсовывать" вместо этих файлов соответствующие файлы mts. Студия же спрашивает, когда не находит файл проекта, указать к нему путь. Вот и укажите вместо wmv mts.