По идее при выводе создаётся два файла: звуковой АС3 и видео m4v. И как только кодировка заканчивается, эти два файла объединяются. На диске, куда выводится проект, должно быть место, может там его не хватает (сбои бывают из-за того, что на C: диске места мало. Потому как временные файлы Premiere по умолчанию сохраняет именно на него) и обязательно почистить медиакэш.