У вас очень нагруженный всевозможными фильтрами и, отсюда, тяжелый проект. Не знаю, какой шумодав в Студии, но для, например, Эдиуса Noise Reduser - очень тяжелый плагин. Насколько понял, у вас некоторые переходы идут еще и в сочетании? Тогда тяжесть возрастает. Я бы рекомендовал вам то, что рекомендовали для спокойного монтажа всегда. И это проходило даже на слабых компьютерах. Тем и спасались в своё время. Возьмите тот или иной фрагмент с наложенными теми или иными эффектами, скопируйте, сделайте новый проект, вставьте туда скопированные сцены и выведите отдельным файлом. А потом этот уже обработанный и выведенный файл в готовом виде ставьте в основной проект. Конечно, придется повозиться и сделать это со всеми вашими перегруженными сценами. Таким образом вы серьёзно облегчите монтажке работу по выводу основного проекта. И, думаю, очень неправильное решение попытка экспорта на флэшку.