Есть такая, иногда проявляющаяся "беда".
Чтобы не перезагружать* компьютер в инсталляторе InnoSetup реализована фича** от Microsoft Restart Manager.

 Ссылка
[Только зарегистрированные и активированные пользователи могут просматривать ссылки. ]

* Перезагрузка и не требуется всегда, а только тогда, когда проводник Windows "держит" библиотеку AMTPShellExt.

** По каким-то системным причинам иногда что-то идёт не так с этим Restart Manager.