есть ли возможность в музыкальной дорожке отключать один из каналов?
Есть такой вариант работы.

1. Сначала отделяете аудио от видео -> Правый клик - Откл. аудио
2. Двойной клик на дорожке отделившегося аудио.
3. Выбираем Эффект - Аудиоэффекты - Канал.

Там и работаем с аудиодорожкой.