Не думаю,что это из-за объёма,у меня после оцифровки кассет в AVI до 40 Гб(и 3 часа бывает).и ничего,вывожу в файл (mpeg2 DVDсовместимый).Кстати,вы выводите как?Может в настройках проекта одно,а в выводе другое?Устанавливали прогу от имени админа?Ладно бы не все переходы просчитывались,но если в начале,конце........Лучше проверьте что у вас творится на линейке,может где пропуски?при неправильных настройках возможны(вырезал кусочек-удалил-а пустое место осталось?)Выставьте время меньше минуты-проверьте.