Файлы с мобильных устройств имеют как правило переменную частоту кадров, выяснить это легче всего программой медиаинфо, она бесплатная, ставится 2 минуты, если частота переменная медиаинфо сообщит об этом.
Для приведения исходного видео к какому либо стандарту, я обычно распаковываю их в avi mjpeg, использую чаще всего ПроКодер, им удобно, можно разжимать пакетно, то есть грузишь в него десятка два и идешь ужинать, он все сделает. Можно и самой студией, но если у вас десяток исходников или больше, то вывод по одному не удобно. Зайдите по ссылке, там описано как можно делать.
 посмотреть здесь
[Только зарегистрированные и активированные пользователи могут просматривать ссылки. ]

На вопрос какой формат будет для Pinnacle стандартным, могу сказать, что почти любой отвечающий принятым и утвержденным стандартам, откройте википедию и там найдете перечень всех параметров и требований принятых стандартов видео.