"стык удалось сделать нормальным ?"
Вы что тут имеете в виду? Звук что ли в месте его отсутствия восстановить? Так его там вообще секунду нет. И взяться, следовательно, неоткуда.
Вы говорили про то, что рассинхрон появляется если последовательно выложенные на таймлайн исходники начинать резать. Насколько понял, в произвольных местах. Что я и делал. Эдиус при разрезке файла в случае появления сдвига звука сразу уведомляет о том. На дорожках появляются соответствующие знаки. Такого не было. Всё ровненько режется без всяких происшествий. Один файл покромсал в куски длительностью минуты по три. Удалил из видео три таких куска. Вывел в мпег с битрейтом 25000. Никакого рассинхрона. Странно ваша камера себя ведет. У меня кэннон понимает карточки памяти с NTFS.
И, кстати, так же прилагаемое к камере программное обеспечение прекрасно соединяет снятые фрагменты в один файл без всяких провалов. Но я этим не пользуюсь, предпочитая монтировать из отдельных кусков. Но моя камера и не режет после каждых снятых 2 Гб. Потому что файловая система правильная.