Во внешних фильтрах он есть и выбран.
Это лишнее и не нужное действие.
Достаточно его выбрать в "Видео-рендерер".

Кое кто забыл удалить предыдущую версию через uninstall.bat и поставил поверху
Вот ведь! Значит, компьютер не персональный - ПК

Если используется одна единственная папка для madVR и была выполнена его установка/регистрация через install.bat, то при выходе новой версии, можно удалить содержимое этой единственной папки, а затем распаковать новую версию в эту единственную папку. Файл настроек settings.bin можно не сохранять, т.к. настройки дублируются в реестре.
Повторной установки/регистрации madVR в этом случае не требуется.