Да не надо в нём работать, закинь в АЕ отрезок видео,где надо вставить переход, через динамик линк, примени эффект Motion Bro и верни назад.
Ну а если уж очень не хочется работать в АЕ, жди, может кто то скинет тебе этот плагин. Значит не очень сильно надо.
Кто хочет решить задачу - ищет возможности, кто нет - ищет причины.