Проблема отнюдь не в AI, там скромные размеры...Самое простое решение - вывести секвенции транзишенов в файл с альфой-как удобно -mov, TIFF или PNG секвенцию, и тупо вставить готовое в ту же секвенцию транса. Все файлы внутри сиквенс просто "замутить" или удалить. Делов на 10 мин и проблема решена...