Ну во первых, сравнительное видео не актуально. Вы для сравнения показываете различные вещи. Раз уж сняли стену, которая занимает 90% от всей картинки, то и на 60d снимите тоже самое. Так как мерцание существенно видно только на стене.
Во вторых, установите полностью ручные настройки на видео, к примеру - диафрагма -4, iso 3200, 1/50 и правильный баланс белого.

Снимите с такими же параметрами и ту же (!) картинку на 6d. Потом поговорим дальше.