Покопалась во внутрях и думаю, что это ограничение вшито в движок ATOM. У самих FXmonster всего 10 пакетов, пакеты которые тут выложены - сделаны сторонними разработчиками. Т.е. "монстры" не думали, что будет столько пакетов для их расширения.

Решение пока только одно, добавлять по необходимости и удалять после использования, благо они удаляются из расширения и ставятся обратно моментально. Печально, что удалить можно только все, по отдельности нельзя.